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| 1898年 |
2月
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2月15日（光绪二十四年正月二十五日）光绪帝诏谕：“京师大学堂，迭经臣工奏请，准其建立，现在亟须开办。”
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6月
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6月11日（光绪二十四年四月二十三五日）光绪帝颁“明定国是诏”，内称：“京师大学堂为各省之倡，尤应首先举办，着军机大臣、总理各国事务王大臣会同妥速议奏”。
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6月26日（光绪二十四年五月初八日）光绪帝诏谕：“前因京师大学堂为各省之倡，特降谕旨，令军机大臣、总理各国事务王大臣回同议奏，即著迅速复奏，毋再迟延。倘再仍前玩愒，并不依限复奏，定即从严惩处不贷”。
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7月
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7月3日（光绪二十四年五月十五）总理衙门奏筹办京师大学堂并拟学堂章程折。所奏拟京师大学堂章程共8章54条。称拟定大学堂章程。其中对办学宗旨、课堂科目、入学办法、分班升级、毕业给奖、聘用教职员、学堂经费等作了规定。
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同日，光绪帝就该奏折诏谕：“现据该王大臣详拟章程，参用泰西学规，纲举目张，尚属周备，即著照所拟办理。派孙家鼐管理大学堂事务，办事各员，亦一体精选，中西并用。”
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7月4日（光绪二十四年五月十六日）上谕：建设大学堂工程事务，著派庆亲王奕劻、礼部尚书许应騤迅速办理。
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7月17日（光绪二十四年五月二十九日）孙家鼐奏请简派工部左侍郎许景澄为大学堂总教习。在许未到任前由孙暂行兼办。
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7月20日（光绪二十四年六月初二日）上谕：“本日奕劻、许应騤奏请将地安门内马神庙地方空闲府第作为大学堂暂时开办之所一折，著总管内务府大臣量为修葺拨用。”
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8月
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8月24日（光绪二十四年七月初八）礼部知照大学堂孙家鼐派员具文赴部请领已铸妥之“钦命管理大学堂事务大臣之关防”一颗。
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同日
户部行片知照大学堂：所有大学堂常年经费及购买中西功课书等银三万七千二百四十五两三钱二分，银库定于初十日开放，相应片行贵学堂，务于是日卯刻持具印领，赴部关支可也。
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8月26日（光绪二十四年七月初十日）孙家鼐为德、意等国强行自荐教习复总理衙门片称：“查中国开设大学堂，乃中国内政，与通商事体不同，岂能比较一律。德国、意国大臣，似不应干预”
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11月
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11月22日（光绪二十四年十月初九日）内务府将地安门内马神庙空闲府第房屋修葺后移交管学大臣接收。于是乃张榜招生：“凡愿入堂肄业者，报名纳卷，甄别取去。”
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12月
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12月3日（光绪二十四年十月二十日）孙家鼐奏大学堂开办情形折称：“现在斋舍仅能容住二百余人，而报名者已一千有零，当先择人品纯正文理优长者录取入堂，以广造就。”并申明办学方法等：“先课之以经史义理，使晓然于尊亲之义，名教之防，为儒生立身之本；而后博之以兵农工商之学，以及格致、测算、语言、文字各门，务使学堂所成就者明体达用。”
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12月31日（光绪二十四年十一月十九日）京师大学堂开学。
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| 1899年 |
1月
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1月8日（光绪二十四年十一月二十七日）孙家鼐据大学堂章程第二节规定“各省学堂皆归大学堂统辖”，咨行各省送交学堂章程等文中称：“......现在京师大学堂业已开办。各省会暨外府州县，所有已设之学堂，均须将学堂章程、教习姓名、学生额数咨送本大学堂，以便核考.......”
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1月（光绪二十四年十二月）《京师大学堂规条》实行。其中对各种礼仪、作息时间、入学条件、分班、功课考核等作了规定
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3月
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（光绪二十五年二月）《京师大学堂禁约》共26款公布。《禁约》对学生的言行、尊师、请假、卫生等违禁记过、斥退等作了详细规定。
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7月
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7月17日（光绪二十五年六月初十日）上谕：“吏部尚书兼管大学堂事务孙家鼐因病予假，以.....吏部右侍郎许景澄暂管理大学堂事务”。
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| 1900年 |
7月
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7月1日（光绪二十六年六月初五日）由于月中旬八国联军由天津进攻北京，义和团在北京焚烧教堂等事变，许景澄奏请暂行裁撤大学堂折内称：“现在京城地面不靖、住堂学生均告假四散。又，该大学堂常年经费......华俄银行均经毁坏......此时无从支银,以后用费用亦无所出......应请将大学堂暂行裁撤。”
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8月
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8月15日（光绪二十六年七月二十一日）八国联军侵入北京，“俄兵德并先后来学堂占住，看守人役力不能支，均已逃散。所有书籍、仪器、家具、案卷等项一概无存。房屋亦被匪拆毁”，大学堂被迫停办。
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| 1902年 |
1月
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1月10日（光绪二十七年十二月初一日）上谕：“从前所建大学堂，应即切实举办。著派张百熙为管学大臣，将学堂一切事宜，责成经理。务期端正趋向，造就通才，明体达用，庶收得人只之效。应如何核定章程，并著悉心妥议，随时具奏。”
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1月11日（光绪二十七年十二月初二日）上谕：“昨已有旨饬办京师大学堂，并派张百熙为管学大臣，所有从前设立同文馆，毋庸隶外交部，著即归并大学堂，一切责成张百熙管理。”
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2月
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2月13日（光绪二十八年正月初六日）据张百熙奏“......臣素悉吴汝纶......主保定莲吃池书院多年，生徒化之，故北方学者以其门称盛，允为海内大师，以之充大学堂教习，洵无愧色......伏候圣裁”上谕：军机大臣等，张百熙奏请派总教习一折，前直隶州冀州知州吴汝纶，著赏加五品卿衔充大学堂总教习。
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同日
张百熙奏筹办京师大学堂情形折拟定办法五条：一办法宜预定也；一讲舍宜添建也；一译局宜附设也；一书籍仪器应广购也；一经费宜宽筹也。折中称：“......应请于预备科之外，再设速成一科。速成科亦分二门：一曰仕学馆，一曰师范馆。.......以上五条，以预定办法一条为总立大纲；以购买书籍仪器、附设译局二条为讲求实用二条为讲求实用；以增建校舍一条为渐拓规模；而尤以宽筹经费一条为诸事根源。均乞恩准实行。
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3月
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3月11日（光绪二十八年二月初二日）礼部知照大学堂：“所有补铸钦命管理大学堂事务之关防一颗，本部现已铸妥，相应知照贵大臣，刻即派员持文赴部请领可也。”
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3月16日（光绪二十八年二月初七日）张百熙咨呈外务部，请候补五品京堂曾广铨到大学堂协助办理交涉事宜。
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6月
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6月14日（（光绪二十八年五月初九）外务部为大学堂呈请派员出洋考察学务事咨复大学堂：现查有大学堂总教习、五品卿衔吴汝纶，提调浙江候补道荣勋，杂务提调、兵部员外郎，堪以派往日本东京等处放询学堂事宜。
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8月
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8月15日（光绪二十八年七月十二日）张百熙奏筹拟学堂章程折内称：“臣此次所拟章程，谨上溯古制，参考列邦，拟定京师大学堂章程，并考选入学章程，暨颁发各省之高等学堂、中学堂、小学堂章程各一份.......蒙学堂章程一份，共六件。一并开呈御览，恭候颁行。”此次所拟大学堂章程共八章八十四节，经钦准颁行，称钦定大学堂章程。
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8月30日（光绪二十八年七月二十七日）京师大学堂上海译书分局为开办情形向大学堂呈文称：“光绪二十八年三月二十六日奉督办南洋公学商务大臣盛面谕：......京师大学堂现于上海设立译书分局，拟与南洋公学译书院合办......遵于四月初一日先行开办......”
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9月
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9月22日（光绪二十八年八月二十一日）分发湖北使用道梅光羲暂留学堂派充藏书楼提调到差。
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11月
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11月30日（光绪二十八年十一月初一日）驻美大使应京师大学堂张百熙之请，将所收集之美国各学堂有关章程共13本送交大学堂。
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12月
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12月14日（光绪二十八年十一月十五日）湖南巡抚为大学堂二十八日电调范源廉事复大学堂文：“......长沙附生范源廉，现由日本回湘，大学堂助教需员，恳属其速来京......查学生范源廉，系湘阴文童，现于光绪二十八年十一月十二日由日本东京回抵湘省，已饬令赶速进京，听候派遣......”
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12月15日（光绪二十八年十一月十六日）管学大臣张百熙奏：“大学堂定期本月十八日开学。先办速成一科，并购地建造校舍”
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12月17日（光绪二十八年十一月十八日）京师大学堂告示：十八日午刻开学。提调率学生依斋舍次序鱼贯而行，诣圣人堂前月台下行礼......两馆学生北面三楫，谒见管学大臣。又东北三楫，谒见总正分助教习，均答楫。又西北面与编译执事个员行相见礼，彼此一楫。堂提调率两馆学生各归斋舍。
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1902年
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《京师大学堂译书局章程》33条颁行。其中有设员、局章、薪俸、领译合约、章程条说等内容。
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《京师大学堂编书处章程》20条颁行。其中对编纂宗旨、分纂各员、各科课本的编选等作了规定
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《京师大学堂堂舍规条》17条颁行。规条详细开例了宿舍、饭厅等管理规定。
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《京师大学堂仕学馆师范馆教习注意条规》6条颁行。其中对教习应作之受业预定书、授页报告书、考试题目等作了规定。
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《京师大学堂仕学馆师范馆讲课条规》9条颁行
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《京师大学堂仕学馆师范馆讲堂事务员职务条规》5条15款颁行
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《京师大学堂提调职务规条》13条颁行
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《大学堂考选入学章程》拟定。其中有《预备科考选入学章程》9节、《速成仕学馆考选入学章程》11节、《速成仕学馆考选入学章程》7节。
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| 1903年
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4月
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4月30日（光绪二十九年四月初四日）京师大学堂学生因闻俄国强占东北三省而鸣钟上堂，教员、学生登台讲演，陈说利害，思筹力争善策，并拟办四事：（一）各省在京官绅告电该省督抚电奏力争；（二）全班学生电致各省督抚，请各督抚电奏力争；（三）全班学生电致各省学堂，由各省学堂禀请督抚电奏力争；（四）大学堂全班学生上禀管学代奏力争。会后发出《京师大学堂师范、仕学两馆学生上书管学大臣请代奏拒俄书》、《京师大学堂师范馆学生请政务处代奏俄约疏》、《京师大学堂学生公致鄂垣书》等
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6月
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6月27日（光绪二十九年闰五月初三日）张百熙等奏，“京师大学堂为学术人才根本，关系至重考究宜详......张之洞为当今第一通晓学务之人......伏恳天恩，特派该督会同商办京师大学堂事宜，一切章程，详加厘定......”为此上谕：“张百熙等奏请派重臣会商学务一折.......著即派张之洞会商张百熙、荣庆将现办大学堂章程一切事宜,再行切实商订，并将各省学堂章程一律厘定，详细具奏。”
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6月（光绪二十九年五月）京师大学堂医学实业馆开学。前此招生，投考者二百余人，定额仅取三十名。
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7月
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（光绪二十九
年六月）京师大学堂译学馆招生告示称：“京师大学堂于上年九十月经本大臣两次考取，速成科均已入堂肄业在案。现在开办译学馆，招选学生额定一百二十名，分习英、德、俄、法、日本五国文字，兼习普通科学，五年毕业......其考试仍分两场,第一场试以修身伦理大义一篇、中外史学六问、算学三问；第二场试以中外地理六问、物理学三问、外国文论一首或笔对数条.......其年龄取自十六岁以外,二十二岁以内为限.今定于七月初一日考试头场,初二日考试二场.......该生等务于六月二十日齐集京师......亲身赴本大学堂报到投考,统于六月二十八日截止......”
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12月
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12月31日（光绪二十九年十一月初三日）军机大臣面谕旨：“本日张百熙等奏选派学生前赴东西洋各国游学一折，师范学生最关紧要，著管学大臣择其心术纯正学问优长者，详细考察，分班派往游学，余依议。钦此。”张百熙奏折称：“......亟应多派学生，分赴东西洋各国，学习专门，以备将来学成回国，可充大学教习......现就速成科学生中选得余启昌......共三十一人，派往日本游学，定于年内起程；俞同奎......共十六人，派往西洋各国游学，定于年外起程......学期约以七年为率。西国十六人，统计需费十万余两；日本三十一人，统计需费九万余两，而川资等项尚不在内......”。
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12月（光绪二十九年十一月）奏定《进士馆章程》5章30节，就办学宗旨、学科程度、入学规则、考验毕业、教员管理员等作了规定：进士馆“以教成初登仕版者皆有实用为宗旨；以明澈今日中外大局，并于法律、交涉、学校、理财、农、工、商、兵八项政事，皆能知其大要为成效。每日讲堂功课四点钟，三年毕业”等。
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奏定《译学馆章程》7章44节，规定以译外国之语文，并通中国之文义为宗旨、以办交涉教译学之员均足供用，并能编纂文典自读西书为成效。每日讲堂功课六点钟，五年毕业。此外对学科、入学、毕业、教员、管理员等作了规定。
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1903年
（光绪二十九年）《京师大学堂光绪癸卯重订规条》颁行。其中包括《全堂通行条规》5节、《汉洋教习职务条规》37节、《堂提调职务条规》16节、《讲堂事务员职务条规》17节、《斋长职务条规》10节、《班长职务条规》13节、《讲堂条规》14节、《讲堂日记条规》6节、《饭厅条规》8节《学生记过条规》49节、《学生陈事条规》18节。
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奏定《京师大学堂医学实业馆章程》4章42节，就建制、课程等项作了规定：馆内分为“习医之处曰习业所，诊治之处曰卫生所”。“馆内设药草园一区，栽种一切生药”。课程则“中西兼课”，以三年为卒业之期”。
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| 1904年 |
1月
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1月13日（光绪二十九年十一月二十六日）张百熙等奏遵旨重定学堂章程妥筹办法折内称：“计拟成初等小学堂章程一册、高等小学堂章程一册、中学堂章程一册、高等学堂章程一册、大学堂章程附通儒院章程一册......初级师范学堂章程一册、优级师范学堂章程一册、任用教员章程一册......初等农工商实业学堂章程一册（附实业补习普通学堂及艺徒学堂各章程）、中等农工商实业学堂章程一册、高等农工商实业学堂章程一册、实业教员讲习所章程一册、实业学堂通则一册......各学堂管理通则一册......学务纲要一册”。此次重定大学堂章程（附通儒院）共计7章72节。是为第三个大学堂章程，称为重定大学堂章程。
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2月
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2月6日（光绪二十九年十二月二十一日）命大理寺少卿张亨嘉充京师大学堂总监督。
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9月
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9月26日（光绪三十年八月十七日）政务处奏拟更定《进士馆章程》8条，对于1903年12月之进士馆章程逐条作了补充修改，使管理更趋完善严格。
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10月
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10月8日（光绪三十年八月二十九日）张亨嘉为准蒋举清入堂听讲复文学布：“据甘肃新疆优贡生蒋举清禀请自备伙食附入预备科随班听讲等情......查该等生拔起荒陬，志规远大，他日归教其乡，亦足以开通风气，自应准如所请。”
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1904年（光绪三十年）《京师大学堂详细规则》颁行。
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| 1905年 |
3月
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3月5日（光绪三十一年正月三十日）张亨嘉奏请开办预备科并添招师范生折内称“.......分咨各直省督抚学政，考选年龄合格品行端正之学生咨送来京，并由臣出示另场招考，择其学识较优者取录三百六十余人，合计旧有之师范生已五百人矣.......至十月中旬，新班学生始行入堂，并添聘英德日本教习。遵照定章，于本年正月二十日开学，分班讲授。此京师大学堂添招学生大概情形也。”
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4月
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4月23日（光绪三十一年三月十九日）学务大臣复大学堂总监督文：“优级师范章程，学生在学费用，均以官费支给，凡洋纸、铅笔、墨水之属，及东西洋教科书，向由学堂颁发，历办无异.......预科学生.......应照师范生一律发给.......”
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5月
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5月28日（光绪三十一年四月二十五日）京师大学堂召开第一次运动会，计有掷槌、八百米突竞走、跳远、跳高、顶囊竞走、掩目拾球竞走、掷球、拉绳、越脊竞走等项目。共进行二日。
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8月
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8月25日（光绪三十一年七月十五日）大学堂总监督张亨嘉奏设分科大学折内称：“.......拟先设政法科、文学科、格致科、工科、以备大学预科及各省高等学堂学生毕业后考入学。此外四科，以次建置.......”
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| 1906年 |
2月
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2月5日（光绪三十二年正月十二日）开缺总监督张亨嘉将大学堂文卷等移交给代理大学堂事务曹广权。
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2月15日（光绪三十二年正月二十二日）“命李家驹以四品京堂候补，充京师大学堂总监督”。
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4月
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4月25日（光绪三十二年四月初二日京师大学堂举行第二次运动会，共进行两日。本次定有《本校学生赴运动会简章》
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8月
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8月21日（光绪三十二年七月初二日）学部分派大学预科师范两监督片称：“查京师大学堂现分两种办法，一为优级师范、一大学预科......奏调本部行走之侯选道江翰、江苏试用知县张祖廉学茂才优，堪以分任。江道著署理优级师范学堂监督兼充教务提调。张令著以教务提调兼署大学预科监督......一切文件仍用大学堂总监督关防。其两馆监督关防，俟分科大学开办后再行另铸。”
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8月26日（光绪三十二年七月初七日）学部奏请将大学堂进士馆甲辰进士现在馆肄业之内班，均送入日本东京法政大学补修科，将外班之分部各员有志游学者，分别选择送入法政大学速成科，学满毕业回京时一律考验，按照定章分别奖励。
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| 1907年 |
1月（光绪三十二年十一月）京师大学堂医学实业馆学生32人毕业。
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1月29日（光绪三十二年十二月十六日）学部奏请处罚不守考规学员折称：进士馆毕业考试查出携带讲义议学员庶吉士顾承曾、法部候补主事吕兴周及不守堂规首先争辩之庶吉士徐谦，均拟请旨将各该员罚俸3个月。奉旨“依议，钦此。”
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2月2日（光绪三十二年十二月二十日）孙家鼐等奏会同考试进士馆毕业学员折中称：臣等钦遵于初七、初八、初九、初十等日亲往进士，按照各学员素习科学分门考验。......将试卷详细校阅，拟定分数，照章与该馆各学期分数平均计算，共计内班学员拟列最优等三十八名、优等二十一名、中等十六名、下等二名；外班学员拟列优等十一名、中等十七名；出洋游学毕业学员拟列优等一名。........候钦定后再由学部遵章办理........。奉旨“知道了。钦此。”
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2月5日（光绪三十二年十二月二十三日）学部奏拟改医学馆为京师专门医学堂折内称：“查京师设有医学馆，拟即改为京师专门医学堂，中西医学分科肄习......。奉旨依议。钦此”
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2月8日（光绪三十二年十二月二十六日）学部奏医学实业馆毕业学生请奖折。奉旨“依议。钦此”折中称：据医学实业馆提调咨称，本年学生已届三年.......兹于九月下旬.......严密考验.......分数在六十分以上者三十六名，请照中学堂章程分别给奖.......所有考验及及格之学生.......均拟照章奖励，一律给予医科贡生，作为正途出身.......”
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2月11日（光绪三十二年十二月二十九日）学部准大学堂师范毕业考试文中称：“.......师范馆旧班学生学期已满，应举行毕业考试.......由部派员就该学堂.......自正月十三日至十八日止，分日考试.......各科学考试，亦即发交原授教习祥拟，分数呈部核定.......”
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3月
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3月18日（光绪三十三年二月初五日）学部咨大学堂文：年十一月.......大学堂师范馆于光绪二十八年十一月内开学.......大学堂师范于光绪二十八年十一月内开学.......至本年十二月底，实已历四年有奇.......准以满四年为毕业之期.......遵照本部奏定各学堂考试章程，分别等.......计取定最优等十八名、优等六十一名、中等二十一名、下等四名.......列榜晓示
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