一个多世纪以来，北京大学作为科学研究的学术重镇，始终屹立在国家科技创新的前沿，在中国科学史和科技史上做出了重要贡献。

进入新世纪以来，北京大学理、工、医科承担和完成的国家自然科学基金项目、国家“973”重点基础研究发展计划项目、国家“863”高技术研究发展计划项目、重大科技专项和国际合作项目等达4000余项。

根据美国ESI公布的过去10年论文引用数据，北京大学的数学、物理、化学、材料、工程、临床医学、动植物学、地球科学、生物和生物化学等11个学科进入全球前1%，其中化学学科论文数排名21位，引用次数排名95位。自1988年到2007年，在全国优秀博士学位论文评选中，北京大学共有61篇博士论文入选。