| 期刊名称 | 统一刊号 | ISSN号 | 创刊时间 | 出版周期 | 编辑部 | 主编 | 备注 |
| 北京大学学报（自然科学版） | 11-2442/N | 1000-0917 | 1955年 | 双月刊 | 学报编辑部 | 赵光达 | |
| 数学进展 | 11-2312/O1 | 1000-0917 | 1955年 | 双月刊 | 数学科学学院 | 柳彬 | |
| 物理化学学报 | 11-1892/O6 | 1000-6818 | 1985年 | 月刊 | 化学与分子工程学院 | 刘忠范 | SCI |
| 大学化学 | 11-1815/O6 | 1000-8438 | 1986年 | 双月刊 | 化学与分子工程学院 | 裴坚 | |
| 地学前缘 | 11-3370/P | 1005-2321 | 1994年 | 双月刊 | 地大、北大 | 翟裕生 | 联办 |
| 北京大学学报（哲学社会科学版） | 11-1561/C | 1000-5919 | 1955年 | 双月刊 | 学报编辑部 | 杨河 | CSSCI |
| 中外法学 | 11-2447/D | 1002-4875 | 1978年 | 双月刊 | 法学院 | 王锡锌 | CSSCI |
| 经济科学 | 11-1564/F | 1002-5839 | 1979年 | 双月刊 | 经济学院 | 刘伟 | CSSCI |
| 国外文学 | 11-1562/I | 1002-5014 | 1981年 | 季刊 | 外国语学院 | 刘锋 | CSSCI |
